Õunapuid istutatakse oktoobrist novembri lõpuni. Puukoolides pakutakse tavaliselt paljasjuurseid puid. Sellel on mõned eelised: puud on odavamad ja sortide arv palju suurem. Konteinerites müüdavad taimed on küll kallimad, kuid pärast maasse istutamist juurduvad kohe ja kannavad vilja aasta varem kui juurduvad puud.Noorte taimedega pottides peaksite alati tähelepanu pöörama substraadi kvaliteedile. Kui muld pole piisav alt juurdunud, võib juurepall ümberistutamise ajal kokku kukkuda.
Puukoolides pakutavad puud on erineva vormi ja kasvujõuga. Madalatüvelised puud arenevad kõige nõrgemini ja pooltüvelised kasvavad neist kiiremini. Viljapuude istutusjärgse vastuvõtmise ja hilisema korraliku kasvu tingimuseks on aukude eelnev ettevalmistamine. Kuumjuursete taimede istutusauk peaks olema piisav alt suur, et kõik juured paindumata sinna sisse mahuks. Üheaastaste neiupuude puhul on dia. 50-60 cm ja sügavus 40-50 cm. Auku kaevates pane ühele poole huumusmuld ja teisele poole sügavamad kihid. Augu põhja on ehitatud väike huumusküngas ja juured on kaetud ühtlaselt asetsevate juurtega.
Nõrgal pinnasel on augud suuremad (sügavus 50-60, läbimõõt 100 cm). Augu põhja tuleb panna kompostimuld. Pikad jämedad võrsed lühendatakse kolmandiku võrra nende pikkusest. Potitaimede jaoks mõeldud auk peaks olema kaks korda suurem kui poti läbimõõt.
Mõlemal ül altoodud juhul peaks vaktsineerimiskoht asuma maapinnast umbes 10 cm kõrgusel. Nõrga kasvujõuga puud on tavaliselt ebastabiilsed ja vastupidavad tugevatele tuuleiilidele, mistõttu tuleb neid toetada lääneküljel asuvate postidega. Äsja istutatud taimi tuleks kasta rohkelt, et muld settiks ja täidaks tühjad õhukambrid, mis tekivad kobestatud, kokkusurumata pinnasesse.
Lõikus või noorenduslõikus tuleks teha kevadel, enne kui puud hakkavad õitsema. Tavapäraste hooldustegevuste osana peaksite muu hulgas: eemaldada liiga suure nurga all kasvavad võrsed külgvõrsetelt ja peavõrse tipust kasvavad külgvõrsed. Puu alumistes osades kasvavad külgvõrsed saab kinni siduda (peaaegu horisontaalasendisse). Nii vähendame veidi nende kasvujõudu (sellised võrsed õitsevad ja kannavad varem vilja). Rida moodustatud puud näevad kõige atraktiivsemad välja, need annavad ka kõige rohkem vilja.Õunapuid saab kohanduda kasvama erinevates mullatingimustes, kuigi nad saavad kõige paremini hakkama kergel, niiskel ja kõrge toitainetesisaldusega substraadil. Nad vajavad kergelt happelist mulda, mille pH on 6,1–6,7. Nad ei talu kasvatamist vett hoidvas pinnases, samuti kohtades, kus varem kasvasid teised õunapuud.